Universer kolliderer i "The Flash", når Barry bruger sine superkræfter til at rejse tilbage i tiden for at ændre fortidens begivenheder. Men da hans forsøg på at redde sin familie pludselig ændrer fremtiden, bliver Barry fanget i en virkelighed, hvor General Zod er vendt tilbage og truer at udslette alt. Medmindre Barry kan lokke en meget anderledes Batman ud af sin pension og redde en fængslet ukendt superhelt fra planeten Krypton.... For at redde den verden, han befinder sig i, og vende tilbage til fremtiden, som han kender, er Barrys eneste håb at løbe for sit liv. Men vil det være nok at give det ultimative offer for at nulstille universet?